日本的港口众多，按照地理位置主要可以分为关东港口和关西港口。以下是一些主要的日本港口：
关东港口
东京港：位于东京湾西北岸，是首都圈地区与国内、海外各地运输的节点。拥有海域面积5453公顷，陆域面积1080公顷，内外贸码头共计24个，泊位总数为115个，其中集装箱码头4个，集装箱泊位16个。
横滨港：位于本州中部东京湾西岸，是日本第三大城市，也是日本最大的海港之一。面积435平方千米，人口已达330万人。横滨地理环境北、西、南三面为丘陵环绕，东面为太平洋。
名古屋港：位于爱知县名古屋市，是日本最大的国际贸易港口之一。货物总吞吐量为2亿824万吨，连续12年位居日本全国第一。
关西港口
大阪港：位于本州西南沿海的中岛川与大和川河口之间，濒临大阪湾的东北侧，是日本五大集装箱港口之一。
神户港：位于兵库县神户市，面临大阪湾，是日本主要的国际贸易港之一，与大阪港同样被指定成超级中枢港湾。
博多港：位于福冈县福冈市，是九州地区的主要港口之一。
此外，其他较为重要的港口还包括福冈港、函馆港、广岛港、川崎港等。
这些港口在日本的不同地区发挥着重要的作用，涵盖了国内贸易、国际贸易以及物流运输等多个方面。
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