九寨沟国家级自然保护区内的主要沟谷包括：
树正沟：
这是九寨沟风景区内一条主要的旅游区段，从沟口起到诺日朗，全长14公里多。主要景点有荷叶寨、盆景滩、芦苇海、双龙海、火花海、卧龙海、树正群海、树正瀑布、树正寨、犀牛海和诺日朗瀑布等。
日则沟：
位于九寨沟的南部，全长16公里，是九寨沟风景线中的精华部分，风光绝美且变化多端。主要景点包括原始森林、草海、天鹅海、箭竹海、箭竹海瀑布、熊猫海、熊猫海瀑布、五花海、珍珠滩、珍珠滩瀑布和镜海等。
则查洼沟：
这是九寨沟现在开发出来最长的一条沟，全长17.8公里。主要景点有长海和五彩池等。
扎如沟：
这是九寨沟最近开发的一条沟，目前还在建设中。
建议游客在游览九寨沟时，可以先了解每条沟的特点和主要景点，以便合理安排行程，充分欣赏九寨沟的自然美景。
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